Çeşme ile Klazomenai arasındaki mesafe yaklaşık olarak 25 kilometredir. Klazomenai, Limantepe'de bulunan bir İon kenti olup M.Ö. 4000'lere kadar uzanan bir tarihe sahiptir. Kent, Geometrik dönemde apsidal ve dikdörtgen planlı evlerle şekillenmiş ve M.Ö. 7. yüzyılda sur duvarlarıyla çevrilmiştir. Pers işgaliyle kesintiye uğramış ancak M.Ö. 525-520 civarında eski alanlara geri dönülmüştür. Zeytinyağı üretimiyle refah artmış, ancak M.Ö. 499'daki İon İsyanı sonrası Klazomenai, Karantina adasında bir ada kenti olarak yaşamıştır. Daha sonra ise fikir ayrılıkları sonucu ikili bir iskân meydana gelmiştir.